Szkoła Doktorska Akademii Wychowania Fizycznego i Sportu w Gdańsku rozpoczęła swoje funkcjonowanie od roku akademickiego 2019/2020 na mocy Zarządzenia Rektora AWFiS nr 20/2019 w sprawie utworzenia Szkoły Doktorskiej Akademii Wychowania Fizycznego i Sportu w Gdańsku.
Szkoła Doktorska podlega Prorektor ds. nauki dr hab. Agnieszce Maciejewskiej- Skrendo, prof. AWFiS Gdańsk.
Działalność Szkoły Doktorskiej Akademii Wychowania Fizycznego i Sportu w Gdańsku prowadzona jest zgodnie z ustawą z dnia 20 lipca 2018 r. – Prawo o szkolnictwie wyższym i nauce oraz aktami wewnętrznymi uczelni (Statut AWFiS w Gdańsku, Regulamin Szkoły Doktorskiej AWFiS w Gdańsku) a także w oparciu o misję, wizję i strategię rozwoju Akademii Wychowania Fizycznego i Sportu w Gdańsku (Strategia Rozwoju Akademii Wychowania Fizycznego i Sportu im. Jędrzeja Śniadeckiego w Gdańsku w latach 2020-2026 opublikowana w Uchwale Senatu nr 22/2025 z 26.06.2025 r.). Szkoła Doktorska stanowi integralną część uczelni i realizuje jej akademickie oraz społeczne posłannictwo.
Dnia 30 kwietnia 2025 r., na mocy ZARZĄDZENIA NR 54/2025 Rektora Akademii Wychowania Fizycznego i Sportu im. Jędrzeja Śniadeckiego w Gdańsku zostało powołane Kolegium Szkoły Doktorskiej, organ pełniący funkcję opiniodawczo-doradczą w sprawach związanych z kształceniem i organizacją Szkoły Doktorskiej.
